最近几年应用生物芯片技术进行基因表达谱分析已成为常用的分子生物学技术。全基因组序列信息的公布和技术的进步，促使生物芯片技术能在基因组等更广范围上进行应用，使分析生物转录组中大部分基因的表达谱成为可能。记得当我第一次看到真实的芯片时是如此的激动。这是发生在1995年，Synteni公司在Palo Alto的DNAX中心演示生物芯片技术，我当时是一名博士后。1998年，作为在上游技术领域的科研人员，我终于有机会成为这一研究领域中的一员。那时，DNA微阵列技术已发展得相当成熟，芯片制备技术和数据分析方法也变得更复杂。写作本书的动机源于2002年3月由我在加利福尼亚大学San Diego Bioscience Extension组织的一门称为“微阵列技术总论”的课程。这提供了一个重要的论坛来探讨生物芯片技术的最新进展和发展趋势。该课程提供了微阵列和基因芯片技术的详细介绍，不断发展的生物芯片研究、微流路技术、设备、点印和检测方法以及成功进行基因表达谱和SNP分析所需方法和试剂等的技术标准。这已成为年度大事，并出版了2003年度会议总结。
本书是一部指导生物芯片研究人员进行实验室操作的技术手册。主要包括四个方面的内容：主要的生物芯片技带；生物芯片实验室与相关仪器设备；生物芯片数据统计分析和数据管理的知识；生物芯片的应用，书中包含大量生物芯片技术的技术细节和实践技巧，并重点提示了如何制备高质量的生物芯片。
　　本书适用于生物芯片研究的技术人员，同时也可供相关专业的研究生参考。

　　Gary Hardiman是美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校（UCSD）生物医学基因组学微阵列芯片实验室（BIOGEM）的负责人。BIOGEM是美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校一个有组织的研究单位和中心实验室，致力于生物芯片技术和生物信息学等高通量基因组学方法的研究。他讲授的一门课程是“从基因到生物学功能概述”，这是该大学（生物科学）药物发现和开发职业强化证书［Extension（Bioscience）Drug Discovery and Development Professional Certifieate］的选修课程。Gary Hardiman博士于2002年3月13～15日组织了UCSD生物芯片技术会议。他毕业于爱尔兰（Gal—way）国立大学，获得微生物学博士学位，他的研究方向是用基因组学方法去阐明疾病的分子机制。

1　生物芯片技术简介
　1.1　引言
　1.2　DNA微阵列芯片的发展过程
　1.3　DNA微阵列和基因芯片
　1.4　基于启动子的DNA微阵列芯片
　1.5　生物芯片操作中遇到的问题
　1.6　芯片检测方法
　1.7　结论
　参考文献
2　微阵列生物芯片操作的实验室自动化
　2.1　为什么要实现实验室的自动化操作？
　2.2　定制微阵列芯片的制作
　2.3　杂交系统的自动化
　2.4　芯片数据的读取——扫描仪
　2.5　实验室的常规自动化
　2.6　总结
　参考文献
3　DNA芯片与生物芯片中心实验室
　3.1　引言
　3.2　点样芯片——寡核苷酸或PCR扩增子？
　3.3　DNA的高通量扩增
　3.4　小鼠单基因微阵列的制备
　3.5　RNA的确定和荧光靶标的标记
　3.6　标记靶标的评价
　3.7　微阵列芯片的预扫描
　3.8　杂交和扫描
　3.9　点制芯片的质量控制
　3.10　芯片点样仪和扫描仪
　3.11　数据分析——克隆跟踪、芯片寻点（spotfinding）以及数据发掘
　3.12　结论
　参考文献
4　生物芯片的纳米颗粒标记
　4.1　引言
　4.2　RLS粒子作为超灵敏检测标记物的基本原理
　4.3　光散射理论和选择便于超灵敏检测的颗粒大小组分
　4.4　仪器
　4.5　蛋白质、DNA探针及配体与RSL颗粒的交联
　4.6　RLS颗粒在固相检测分析中的检测灵敏度和检测范围
　4.7　应用
　致谢
　参考文献
5　如何评估生物芯片扫描仪
　5.1　引言
　5.2　扫描仪的校准
　5.3　总结
　参考文献
6　全基因组水平mRNA表达谱分析在农业基因组学研究中的应用
　6.1　引言
　6.2　基因转录谱分析芯片
　6.3　对未测序植物的可选方法
　6.4　农业研究中的应用范围
　6.5　整合互补的基因组数据
　6.6　结论
　参考文献
7　生物芯片技术在药物靶标确证和新药发现中的应用
　7.1　基因组学和药物发现
　7.2　单核苷酸多态性和Crohn病
　7.3　微阵列技术和精神分裂症
　参考文献
8　蛋白质芯片在蛋白质组学中的应用
　8.1　引言
　8.2　芯片构造与表面化学
　8.3　结合蛋白的检测
　8.4　蛋白质芯片的应用
　8.5　结论
　致谢
　参考文献
9　SpanscriptTM：快速获取非冗余cDNA3′端文库用于制备微阵列芯片的
10　生物芯片数据管理陆祖宏刘全俊潘品良译
11　用LFC模型从芯片数据中鉴定差异表达基因仇华吉李娜译
12　应用50mer寡核苷酸芯片分析线虫基因
13　生物芯片技术检测大鼠体内药物诱导氧化酶P450 mRNA及其他药物代谢相关基因表达水平:在药物筛选与开发中的应用
14　寡核苷酸芯片技术在突变分析中的开发与应用
15　生物芯片技术比较、统计分析和实验设计
16　INFINITITM系统：临床实验室的自动化多功能芯片平台