应用微生物学是生物技术、食品工程和环境工程等专业的必修课。运用微生物资源生产发酵产品以及防治有害微生物，包括微生物资源及其开发利用、菌种选育的原理与方法、发酵工艺及其控制、微生物在冶金、能源、环境等领域的应用等，为全面学习生命科学和技术奠定基础。
　　本书围绕高职高专相关专业的培养目标，在能力本位、就业导向、任务驱动、工学结合等职业教育新理念的指导下，阐述了微生物技术应用的基础原理与实践操作技能等，具体包括微生物的主要类群、微生物的生理、微生物的遗传变异与菌种选育、微生物的生态、微生物在环境治理中的作用、微生物与现代食品工业、应用微生物学实验技术等有关内容。本书突出了以下特点：
　　第一，理论以“必需、够用”为度。应用微生物学虽是专业基础课，但其重要功能在于为学生形成综合职业能力服务。本书在讲解理论时力求简明易懂、深入浅出。
　　第二，强调行动导向。本书设计了三个部分：技能基础、技术项目和任务设计，具有显著的职业教育教材的特点，能很好地满足学生专业发展的需求。
　　第三，突出校企结合、工学结合。本书在内容上，力求学校教学与工场现场操作相结合，注重理论与实践的有机融合；在编写队伍上，由优秀教师与企业优秀人才精诚合作，共同完成，确保了本书的实用性。

技能基础篇
　第一章　绪论
　　第一节　微生物概念及其生物学特性
　　第二节　微生物学的要领及研究对象　
　　第三节　微生物学的形成和发展
　　第四节　微生物的应用与前景
　第二章　微生物的主要类群
　　第一节　原核微生物
　　第二节　真核微生物
　　第三节　非细胞型微生物
　　第四节　藻类
　　第五节　原生动物
　　第六节　后生动物
　第三章　微生物的生理
　　第一节　微生物细胞的化学
　　第二节　微生物的长生
　　第三节　微生物的代榭
　第四章　微生物的遗传变异与菌种选育
　　第一节　微生物遗传变异的物质基础
　　第二节　微生物的菌种选育
　　第三节　微生物菌种保藏及复壮
　第五章　微生物的生态
技能应用篇
　第六章　微生物在环境治理中的作用
　第七章　水中致病微生物的检验和控制
　第八章　微生物与现代食品工业
　　第一节　微生物与发酵食品
　　第二节　微生物引起食品腐败
　　第三节　微生物与食品的腐败变质
　　第四节　食品卫生与食品检验
技能实践篇
　第九章　应用微生物学项目技术
附录一　常用培养基及制备
附录二　常用染液配制
参考文献