温疫，相当于现代医学所讲的传染病，它对人类的危害很大，在一定的外界环境条件下可以在人群中传播，造成流行。温疫流行时，发病迅速，症状剧烈，波及人数多，影响范围大，严重危害广大人民的生命健康。
《温疫论》在传染病的病源、病因以及免疫性、流行性的大量论述都十分科学。尤其在17世纪中叶细菌学出现之前，《温疫论》提出了：“夫温疫之为病，非风非寒，非暑非湿，乃天气间别有一种异气所感”，这种异气即“戾气”。这种学说是十分先进的。《温疫论》对温疫的免疫性的论述也确是十分令人敬佩。书中说：“至于无形之气，偏中于动物者，如牛瘟、羊瘟、鸡瘟；鸭瘟，岂但人疫而已哉?然牛病而羊不病，鸡病而鸭不病，人病而禽兽不病，究其所伤不同，因其气各异。”真是一段绝妙的阐述。

吴有性 　　明代医学家。字又可，江苏吴县人。居于太湖纲庭山。精医术，尤擅长温病。明末崇祯年间，北方大疫，死者枕藉，人多以伤寒治法治之而不效。有性怀革新之思想，推究其病源，察其传变。认为温病之为病，非风非寒，非温非暑，而是由天地间别有一种戾气，或称疠气、杂气，与伤寒不同。其病系口鼻内，伏于膜原，其邪在半表半里之间。其戾气具有特适性、偏中性，乃指某种动物于某种戾气有亲和力，而其他动物则不病；对侵入的某一动物的一种器官有亲和力，则不侵犯其他器官。而戾气之侵入是否有发病之可能，则与机体之强弱相关。此论点于吴氏之著作《瘟疫论》中表达无遗。另又提出其特殊的“三消”、“达原”等疗法，以治疗瘟疫证。其学说为后世所推崇，亦是后代温病学说的形成和发展有重大影响，故《四库全书总目》谓其“推究病源，参稽医案，著为此书，瘟疫一证，始有绳墨之可守，亦可谓有功于世矣。”现《瘟疫论》有多种版本行世。

卷上
原病
温疫初起
传变不常
急证急攻
表里分传
热邪散漫
内壅不汗
下后脉浮
下后脉复沉
下后脉复沉
邪气复聚
下后身后热
下后脉反数
因证数攻
病愈结存
下格
注意逐邪勿拘结粪
蓄血
发黄
邪在胸膈
辨明伤寒时疫
发斑战汗合论
战汗
自汗
盗汗
狂汗
发斑
数下亡阴
……
卷下