全书共计14章，首先根据历代金陵地方志论述了金陵之形势，对其山川、河流、城池详加考证，并以历史史料编出金陵大事年表。从第三章起分代记述了秦汉以前之遗址、六朝城郭宫阙遗址、六朝陵墓、南朝四百八十寺、隋唐之遗址、南唐遗址、宋元之遗址、明代之遗址、满清及太平天国遗迹、近代之玄观祠宇及梵刹、园林及宅第等。

序
自序
凡例
结论
第一节 研究之范围与方法
第二节 参考之书目
第一章 金陵之形势
第一节 概论
第二节 山脉
甲 钟山龙蟠 石城虎踞
乙 覆舟山
丙 鸡笼山
丁 卢龙山
戊 马鞍山 清凉山 小仓山 冶城山
已 仓山 大庄观山 直渎山 幕府山
庚 栖霞山
辛 阳山 汤山
壬 青龙山 黄龙山 赤山 方山
癸 牛首山 献花岩（祖堂山） 岩山 三山 雨花台
第三节 水系
甲 长江天堑
乙 秦淮河
丙 九曲青溪及运渎
丁 玄湖
第二章 金陵大事年表
第三章 秦汉以前之遗迹
第一节 冶城
第二节 越城
第三节 楚金陵邑
第四节 钟山汉秣陵尉蒋子文祠
第五节 青溪小姑祠
第六节 诸葛武侯驻马坡
第七节 六朝以前金石
第四章 六朝城郭宫阙遗址
第一节 吴都建邺及太初宫
第二节 六朝水道考
第三节 建康
第四节 台城
第五节 六朝都城宫城分考
第六节 萧梁一代之文物
第五章 六朝陵墓