由于祝氏有博大精深的中西医造诣、雄辩的口才、较高的威望，因此他变革中医的主张影响很大，成为当时中西医改革派的中坚人物。祝氏“从事中医革命40年”，其融会新知、改革中医的思想精华都集中体现在他的代表作《伤寒质难》中。该书出版时，在医学界引起很大的震动。随后，陆渊雷进京参加第一届全国卫生会议时，曾携此书向在全的西医同道征求《质难》之质难，在医学界又引起了极大的轰动，被认为是解放后的中医界主张中西医结合的早期佳作。该书以科学论中医，并融会西医知识来阐释 《伤寒论》。本书以问答形式阐发了祝氏对仲景学说的见解。其中，陈苏生的质疑问用五号仿宋体，祝味菊的回答及其他阐述部分用五号宋体，以方便读者辨识及阅读。

祝味菊（1884～1951），别号傲霜轩主。浙江绍兴人。祖上世代业医。后祝氏投考军医学校，学习两年，乃随教师石田东渡日本。次年返蜀，供职于成都官医院，1917年移居上海。曾执教于上海中国医学院，后受聘担任上海新国中医学院研究院院长。祝氏治病首重阳气，认为阳衰一分则病进一分；正旺一分则邪却一分。临证好用温热剂，因擅用附予，人咸称“祝附予”。祝氏学贯中西，学学术生颇多创见。其有关伤寒病理观及邪正、阴阳之见，与世医颇不相同。1944年与门人陈苏生质问难，阐终其学术观点，成《伤寒质难》6卷。

周序
徐序
兰纳序
秦序
章序
自序
发凡篇第一
客邪区分有机无机篇第二
潜伏期篇第三
前驱期篇第四
进行期篇第五
极期篇第六
退行期及恢复期篇第七
伤寒五段大纲篇第八
太阳篇第九
附辨温热病篇第十
少阳上篇第十一
少阳下篇第十二
阳明上篇第十三
阳明下篇第十四
少阴上篇第十五
少阴下篇第十六
厥阴上篇第十七
厥阴下篇第十八
跋
附：创设“中医实验医院”建议书