本志对于厦门地区佛教的地方特点突出分章，重点志述。厦门佛教地方特点之一为历史上岩多于寺。明代以前大部以岩见称，为寺称者则寥寥无几。如有明一代，厦门本岛以岩称者共13座。清末民初，本岛又出现10多所以堂见称的首场。鉴于以岩、寺、堂见称的道场，不仅各有历史因成的时代背景和地理环境，而且在建设规模以至所属性质等方面，均有不同的特点，因此仍以岩、寺、堂等分别立章志述。此外，在佛门四众弟子之外另有带发出家住寺的菜姑，以及岩僧入住神道宫庙这两大地方特点，均分别另立章节重点志述。
　　作为佛教专业志书，对于佛教内部一些不为一般常人所知的诸如教徒的规戒生活以及各种宗教活动等，本志特立专章以“引古证今”的方式详加志述，以加深一般读者对佛教文化特点的认识。

序一
序二
凡例　
概述
大事记
卷之一
　第一章　寺
　第二章　院
　第三章　岩（洞）
　第四章　庵堂（林、精舍）
　第五章　住僧宫庙
卷之二　
　第六章　四众弟子
　　第一节　僧尼
　　第二节　居士
　　第三节　菜姑
　第七章　宗门法系
　　第一节　大乘八宗
　　第二节　闽传南禅
　第八章　佛门规戒
　　第一节　戒律
　　第二节　清规
　第九章　弘法利生
　　第一节　讲经说法
　　第二节　法会活动
　　第三节　佛教刊物
　　第四节　经书流通
　　第五节　慈善事业
卷之三
　第十章　社团组织
　　第一节　佛教（协）会
　　第二节　居士组织
　　第三节　慈善组织
　第十一章　学校教育
　　第一节　闽南佛学院
　　第二节　其他院校
　第十二章　海外交流
　　第一节　新加坡和马来西亚
　　第二节　菲律宾
　　第三节　缅甸
　　第四节　日本　
　　第五节　其他国家
　附录：港台地区
　第十三章　行政管理
卷之四
　第十四章　僧伽传
　第十五章　居士（菜姑）传
卷之五　文献选辑
　一　诗词　
　二　楹联
　三　题词
　四　碑文
　五　法制文牍
跋
编后记
附：卷目索引