敦煌文献被发现之后，学者们从各个方面进行了研究，其中包括医药方面的内容。虽然从总量而言，医药内容在卷子中所占比例甚少，而且大多夹杂在佛经的卷子中，查阅寻检很不方便，但还是引起了前辈学者的注意，并为医药卷子作了初始的整理、编目或序跋，如罗振玉、王国维、王重民、向达、范行准、姜亮夫等。其后医药卷子逐渐受到重视，向着集中处理的方向发展，从单篇论文的研究发展到全部内容的研究，研究的广度和深度都不断加强。

前言
张仲景《五藏论》一卷（P·2115）
张仲景《五藏论》一卷（P·2755）
《明堂五藏论》一卷（P·3655）
《伤寒论·伤寒例》（P·3287）
辅行诀脏腑用药法要
《灸法图》（S·6168）
《灸法图》（S·6262）
《新集备急灸经》（P·2675）
《灸经明堂》（S·5737）
《人神日忌》（P·3247）
《素问·三部九候论》（P·3287）
《灵枢·邪气脏腑病形》（P·3481）”
《伤寒论·辨脉法》（S·202）
《平脉略例》一卷（S·5614）
《五藏脉候阴阳相乘法》（S·5614）
《占五藏声色源候》（S-5614）
《玄感脉经》（P·3477）
《青乌子脉诀》（P·3655）
《七表八里三部脉》（P·3655）
《不知名氏辨脉法》之一（P·3287）
《不知名氏辨脉法》之二（P·3287）
《新修本草·序例》（无编号）
《新修本草·草部·卷十》（P·3714）
《新修本草》（P·3822）
《新修本草》（S·4534）
《食疗本草》（S·76）
《本草经集注第一·序录》（龙·530）
方书（S·3347）
方书（S·5435）
方书（P·2565）
方书（P·2662）
方书（P·2662）
方书（P·2882）
方书（P·3144）
方书（P·3596）
方书（P·3731）
方书（P·3885）
《王宗无忌单方》（P·2635）
《单药方》（P·2666）
《脚气、疟病方书》（P·3201）
《杂疗病药方》（P·3378）
《头目产病方书》（P·3930）
《黑帝要略方》（P·3960）
《疗胸痹心痛医方残片》（S·碎079）
《治病药名文书》（S·1467和S·1467　2）
《简便医方方书》（S·3395）
《面脂薰香方书》（S·4329）
《求子方书》（S·4433）
《妇科单验方书》（S·61772）
《疗服石方》（罗振玉藏）
《服食养生方》（S·6052）
《服气休粮及妙香丸子方》（P·3043）
《道家养生方》（P·4038）
《绝谷仙方》（S·2438）
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